Мероприятия. Клиническая микробиология и антимикробная резистентность, мониторинг за резистентностью к антибиотикам на региональном и межрегиональном уровнях, публикация методической литературы.
Научно-практический семинар «Молекулярная медицинская бактериология» - фото - 1

Научно-практический семинар «Молекулярная медицинская бактериология»

21-25 октября 2024
Смоленск
Общая информация

Уважаемые коллеги!

Приглашаем вас принять участие в учебном научно-практическом семинаре «Молекулярная медицинская бактериология».

Даты проведения: 21 – 25 октября 2024 г.

Место проведения: НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ) ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России; г. Смоленск, ул. Кирова, 46А. (Яндекс-Карта)

Форма обучения: лекции и практические занятия.

Рассматриваемые темы:

  1. Современные методы видовой идентификации бактерий: возможности и ограничения:
  • MALDI-TOF MS: оборудование, базы данных и алгоритмы идентификации.
  • Таргетные амплификационные методы.
  • Таргетное секвенирование (Сэнгер и NGS) 16S рРНК, rpoB и других локусов.
  • Полногеномное секвенирование (WGS) и алгоритмы анализа данных.
  • Анализ состава микробных сообществ (метагеномные методы).
  1. Выявление генетических факторов антибиотикорезистентности и патогенности бактерий:
  • Фенотип и генотип резистентности. Наиболее важные генетические маркеры.
  • Таргетные амплификационные методы.
  • Анализ резистома и вирулома на основании данных WGS: базы данных и алгоритмы анализа.
  1. Субвидовое типирование и молекулярная эпидемиология приоритетных бактериальных патогенов:
  • Терминология, основные методы типирования.
  • Филогенетический анализ.
  • Структура популяции, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность отдельных бактериальных возбудителей.
  1. Природные плазмиды и мобильные генетические элементы, связанные с распространением генов резистентности и вирулентности: выявление и филогенетический анализ на основе данных WGS.
  2. Современное оборудование и материалы для проведения молекулярно-генетических и геномных исследований в микробиологии.

Программа семинара будет размещена позже на данной странице в разделе «Программа». В настоящее время формируется заявка на регистрацию Семинара в системе НМО.

Внимание! Для регистрации заявки на участие необходимо заполнить онлайн-регистрационную форму. Регистрация заявок на участие будет открыта 16 сентября. Количество участников семинара ограничено. Решение о принятии к участию в семинаре принимается организационным комитетом на конкурсной основе.

Стоимость участия: 30 тыс. руб. В стоимость входит участие в лекционных и практических занятиях, кофе-брейки, информационные материалы, сумка участника, именной бэйдж, сертификат участника.

Оплата транспортных расходов и проживания осуществляется участниками отдельно. По вопросам бронирования проживания рекомендуем обращаться в гостиницы: Гранд-отель "Мегаполис" или Отель City, находящиеся в непосредственной близости от места проведения Семинара.

По всем вопросам, связанным с Семинаром, просьба обращаться к куратору Елене Юрьевне Склееновой (email: elena.skleenova@antibiotic.ru; тел. +7-903-890-5278).

Программа

Программа научно-практического семинара «Молекулярная медицинская бактериология»

21 октября (понедельник)

09:00-09:30 Регистрация участников
09:30-10:30 Открытие семинара. Представление участников. Распределение участников на группы
10:30-10:50 Перерыв
Практические занятия
10:50-14:00 Выделение геномной ДНК бактерий для нанопорового секвенирования. Определение концентрации и контроль качества выделенной ДНК. Подготовка геномных библиотек методом быстрого баркодирования. Контроль качества библиотек. (Демонстрация)
(Т.А. Ягудин, Э.Р. Шайдуллина)
14:00-15:00 Перерыв
Лекции
15:00-15:40 Современные методы видовой идентификации бактерий: возможности и ограничения
(М.В. Эйдельштейн)
15:40-16:20 Видовая идентификация бактерий на основе данных полногеномного секвенирования (WGS)
(В.В. Шаповалова)
16:20-16:40

Комплексное NGS решение для метагеномных микробиологических исследований
(П.А. Чернобавский)

16:40-17:00

Развитие технологии MALDI-TOF MS в микробиологии
(П.А. Костин)

 

22 октября (вторник)

Лекции
09:00-09:40 Фенотип и генотип резистентности. Использование молекулярно-генетических методов для выявления резистентности к антибиотикам
(М.В. Эйдельштейн)
09:40-10:20 Методы амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) для выявления бактериальных возбудителей и генетических детерминант антибиотикорезистентности непосредственно в клиническом материале
(И.А. Эйдельштейн)
10:20-11:00

Биоинформатический анализ данных геномного секвенирования (WGS): выявление и аннотация детерминант антибиотикорезистентности
(В.В. Шаповалова)

11:00-11:30 Перерыв
11:30-12:10 Технология нанопорового секвенирования: решения для геномики микроорганизмов
(Т.А. Ягудин)
12:10-13:00

Интерактивный опрос

13:00-14:00 Перерыв
Практические занятия
14:00-16:30 Загрузка геномных библиотек в ячейки. Проверка ячеек и запуск нанопорового секвенирования. Контроль процесса секвенирования. Возможные проблемы и способы их устранения
(Т.А. Ягудин)
16:30-18:00 Видовая идентификация бактерий с помощью различных систем MALDI-TOF MS. Использование дополнительных алгоритмов для дифференциации родственных видов
(Э.Р. Шайдуллина)

 

23 октября (среда)

Лекции
09:00-09:20 Перспективы развития отечественного приборостроения и новая концепция построения баз данных масс-спектров микроорганизмов
(И.С. Фролов)
09:20-09:50 Субвидовое типирование микроорганизмов: терминология и основные методы
(А.В. Романов)
09:50-10:30 Филогенетический анализ на основе данных таргетного и геномного секвенирования
(В.В. Гостев)
10:30-11:00 Перерыв
11:00-11:40 Молекулярная эпидемиология и эволюция ведущих грамположительных патогенов
(В.В. Гостев)
11:40-12:00 Современные молекулярно-генетические технологии. Оборудование и расходные материалы компании Qvadros Bio
(А.В. Лоскович)
12:00-12:20 Международная программа внешней оценки качества молекулярной диагностики QCMD
(Н.М. Михеев)
Практические занятия
12:20-12:50 Выявление Helicobacter pylori и мутаций устойчивости к макролидам и фторхинолонам в клиническом материале с использованием автоматической платформы MultNAT
(И.А. Эйдельштейн, Г. Янин)
12:50-14:00 Перерыв
14:00-17:00 Обзорная экскурсия по городу Смоленску

 

24 октября (четверг)

Лекции
09:00-09:40 Популяционная структура, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность Klebsiella pneumoniae species complex
(Э.Р. Шайдуллина)
09:40-10:20 Популяционная структура, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter baumannii
(Е.А. Шек)
10:20-10:50 Современные отечественные разработки в области массового параллельного секвенирования
(Я.И. Алексеев)
10:50-11:20 Перерыв
11:20-12:00 Молекулярно-биологические методы антигенной и генетической характеристики Streptococcus pneumoniae
(К.О. Миронов)
12:40-13:40 Перерыв
Практические занятия
13:40-14:00 Анализ результатов выявления Helicobacter pylori и генотипов устойчивости к макролидам и фторхинолонам
(И.А. Эйдельштейн, Г. Янин)
14:00-17:00 Биоинформатический анализ результатов геномного секвенирования:
(I) Проверка качества данных секвенирования. Cборка генома. Метрики качества сборки генома
(В.В. Шаповалова, Э.Р. Шайдуллина)

 

25 октября (пятница)

Практические занятия
09:00-11:00 Биоинформатический анализ результатов геномного секвенирования:
(II) Видовая идентификация
(В.В. Шаповалова, Э.Р. Шайдуллина)
11:00-11:20 Перерыв
11:20-13:00 Биоинформатический анализ результатов геномного секвенирования:
(III) Идентификация генов резистентности и вирулентности. Дополнительные вопросы. Обсуждение результатов
(В.В. Шаповалова, Э.Р. Шайдуллина)
13:00-14:00 Интерактивный опрос. Подведение итогов семинара

 

НМО

Семинар одобрен в системе непрерывного медицинского образования (НМО) — 12 кредитов.

Целевые специальности - бактериология; вирусология; клиническая лабораторная диагностика; клиническая фармакология; Лечебное дело; медицинская микробиология; организация здравоохранения и общественное здоровье; эпидемиология.

Регистрация
Уважаемые коллеги, Искренне благодарим вас за интерес к Семинару! В настоящее время регистрация заявок на участие в Семинаре завершена. Поскольку количество поданных заявок значительно превосходит число доступных мест, Оргкомитет проведет отбор заявок на конкурсной основе и будет стремиться удовлетворить заявки представителей максимально большего числа различных организаций. Оргкомитет отправит по электронной почте решение о рассмотрении заявки на участие в Семинаре в срок не позднее 27 сентября.
Фото

Больше фотографий в альбоме сообщества: https://vk.com/album-147466881_304856054

dsc_5958_2