- Главная
- Мероприятия
- Научно-практический семинар «Молекулярная медицинская бактериология»
Научно-практический семинар «Молекулярная медицинская бактериология»
7-17 октября 2025
Смоленск
Общая информация
Уважаемые коллеги!
Приглашаем вас принять участие в учебном научно-практическом семинаре «Молекулярная медицинская бактериология».
Даты проведения: 7 – 17 октября 2025 г.
Место проведения: НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ) ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России; г. Смоленск, ул. Кирова, 46А. (Яндекс-Карта)
Форма обучения: лекции и практические занятия.
Рассматриваемые темы:
- Современные методы видовой идентификации бактерий: возможности и ограничения:
- MALDI-TOF MS: оборудование, базы данных и алгоритмы идентификации.
- Таргетные амплификационные методы.
- Таргетное секвенирование (Сэнгер и NGS) 16S рРНК, rpoB и других локусов.
- Полногеномное секвенирование (WGS) и алгоритмы анализа данных.
- Анализ состава микробных сообществ (метагеномные методы).
- Выявление генетических детерминант антибиотикорезистентности у бактерий:
- Фенотип и генотип резистентности. Наиболее важные механизмы и маркеры резистентности.
- Таргетные амплификационные методы.
- Анализ резистома на основании данных WGS: базы данных и алгоритмы анализа.
- Субвидовое типирование и молекулярная эпидемиология приоритетных бактериальных патогенов:
- Терминология, основные методы типирования.
- Филогенетический анализ.
- Структура популяции, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность отдельных бактериальных возбудителей.
- Природные плазмиды и мобильные генетические элементы, связанные с распространением генов резистентности и вирулентности: выявление и филогенетический анализ на основе данных WGS.
- Современное оборудование и материалы для проведения молекулярно-генетических и геномных исследований в микробиологии.
Семинар аккредитован в системе НМО (12 кредитов) по специальностям:
- бактериология
- вирусология
- генетика
- инфекционные болезни
- клиническая лабораторная диагностика
- клиническая фармакология
- лечебное дело
- медицинская микробиология
- организация здравоохранения и общественное здоровье
- эпидемиология
Стоимость участия: 60 тыс. руб. В стоимость входит участие в лекционных и практических занятиях, кофе-брейки, информационные материалы, сумка участника, именной бэйдж, сертификат участника.
Оплата транспортных расходов и проживания осуществляется участниками отдельно. По вопросам бронирования проживания рекомендуем обращаться в гостиницы: Гранд-отель "Мегаполис" или Отель City, находящиеся в непосредственной близости от места проведения Семинара.
По всем вопросам, связанным с Семинаром, просьба обращаться к куратору Елене Юрьевне Склееновой (email: elena.skleenova@antibiotic.ru; тел. +7-903-890-5278).
Программа
7 октября (вторник)
| 09:00-09:30 | Регистрация участников |
| 09:30-10:30 | Открытие семинара. Представление участников. Распределение участников на группы |
| Лекции | |
| 10:30-11:30 | Современные методы видовой идентификации бактерий: возможности и ограничения (М.В. Эйдельштейн) |
| 11:30-11:45 | Перерыв |
| 11:45-12:20 | Развитие технологии MALDI-TOF MS в микробиологии (П.А. Костин) |
| 12:20-12:55 | Перспективы развития отечественного приборостроения и новая концепция построения баз данных масс-спектров микроорганизмов (И.С. Фролов) |
| 12:55-14:00 | Перерыв |
| Практические занятия | |
| 14:00-17:00 | Видовая идентификация бактерий с помощью различных систем MALDI-TOF MS. Использование дополнительных алгоритмов для дифференциации родственных видов (Э.Р. Шайдуллина) |
8 октября (среда)
| Лекции | |
| 9:00-10:00 | Фенотип и генотип резистентности. Использование молекулярно-генетических методов для выявления резистентности к антибиотикам (М.В. Эйдельштейн) |
| 10:00-10:45 | Методы амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) для выявления бактериальных возбудителей и генетических детерминант антибиотикорезистентности непосредственно в клиническом материале (М.В. Эйдельштейн) |
| 10:45-11:00 | Перерыв |
| 11:00-11:30 | Субвидовое типирование микроорганизмов: терминология и основные методы (А.В. Романов) |
| 11:30-12:15 | Интерактивный опрос |
| 12:15-13:25 | Перерыв |
| Практические занятия | |
| 13:25-16:30 | Выявление Mycoplasmoides (Mycoplasma) pneumoniae и мутаций устойчивости к макролидам с помощью ПЦР-РВ (Ю.А. Савочкина, И.А. Эйдельштейн) |
9 октября (четверг)
| Лекции | |
| 9:00-10:00 | Филогенетический анализ на основе данных таргетного и геномного секвенирования (В.В. Гостев) |
| 10:00-11:00 | Молекулярная эпидемиология и эволюция ведущих грамположительных патогенов (В.В. Гостев) |
| 11:00-11:20 | Перерыв |
| 11:20-12:05 | Молекулярная эпидемиология возбудителей ИПП: Neisseria gonorhoeae, Chlamydia trachomatis, Treponema pallidum (Н.Ю. Носов) |
| 12:05-13:15 | Перерыв |
| Практические занятия | |
| 13:15-16:00 | Количественное определение ДНК бактерий, вызывающих инфекции мочевыводящих путей, выявление генов карбапенемаз и CTX-M БЛРС с помощью LAMP (Ю.А. Савочкина, И.А. Эйдельштейн) |
| 16:00-17:00 | Выявление продукции карбапенемаз и CTX-M БЛРС с помощью иммунохроматографических тестов (Е.Ю. Склеенова) |
10 октября (пятница)
| Лекции | |
| 9:00-9:30 | Видовое разнообразие и антибиотикорезистентность представителей Enterobacter cloacae complex (В.А. Оловянников) |
| 9:30-10:30 | Популяционная структура, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность Klebsiella pneumoniae species complex (Э.Р. Шайдуллина) |
| 10:30-10:50 | Перерыв |
| 10:50-11:35 | Механизмы антибиотикорезистентности и молекулярная эпидемиология Escherichia coli, устойчивых к новейшим бета-лактамам и комбинациям с ингибиторами бета-лактамаз (М.В. Эйдельштейн) |
| 11:35-12:15 | Диагностика инфекционных заболеваний и оценка миробиоценозов: обзор тест-систем компании ДНК-Технология (Л.О. Иноземцева) |
| 12:15-13:15 | Перерыв |
| 13:15-13:55 | Интерактивный опрос |
| Практические занятия | |
| 13:55-17:00 | Количественное определение ДНК бактерий, вызывающих инфекции мочевыводящих путей, выявление генов карбапенемаз и CTX-M БЛРС с помощью LAMP (Ю.А. Савочкина, И.А. Эйдельштейн) |
13 октября (понедельник)
| Лекции | |
| 9:00-9:30 | Введение в высокопроизводительное (массовое параллельное) секвенирование (NGS) (В.В. Леонов) |
| 9:30-10:10 | Технологические решения MGI Tech для геномных и метагеномных микробиологических исследований (Р.А. Юнес) |
| 10:10-10:30 | Перерыв |
| Практические занятия | |
| 10:30-13:00 | Выделение геномной ДНК бактерий для полногеномного секвенирования (WGS) (Э.Р. Шайдуллина) |
| 13:00-14:00 | Перерыв |
| Лекции | |
| 14:00-14:40 | Современные отечественные разработки в области массового параллельного секвенирования (Я.И. Алексеев) |
| Практические занятия | |
| 14:40-17:30 | Определение концентрации и контроль качества геномной ДНК для проведения секвенирования. (Э.Р. Шайдуллина, Я.И. Алексеев) |
14 октября (вторник)
| Лекции | |
| 9:00-9:30 | Популяционная структура, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность Acinetobacter spp. (М.В. Эйдельштейн) |
| 9:30-10:00 | Популяционная структура, молекулярная эпидемиология и антибиотикорезистентность Pseudomonas spp. (В.В. Леонов) |
| 10:00-10:20 | Перерыв |
| 10:20-10:50 | Обзор технологии нанопорового секвенирования от компании Oxford Nanopore Technologies (ONT) (Т.А. Ягудин) |
| 10:50-11:20 | Методы подготовки геномных библиотек для нанопорового секвенирования (Т.А. Ягудин) |
| Практические занятия | |
| 11:20-12:00 | Проверка ячеек для нанопорового секвенирования (Э.Р. Шайдуллина) |
| 12:00-13:00 | Перерыв |
| 13:00-16:00 | Подготовка геномных библиотек для нанопорового секвенирования. Контроль качества библиотек (Э.Р. Шайдуллина) |
| 16:00-17:30 | Загрузка геномных библиотек в ячейки. Запуск нанопорового секвенирования. Возможные проблемы и способы их устранения (Э.Р. Шайдуллина) |
15 октября (среда)
| Лекции | |
| 9:00-9:45 | Видовая идентификация бактерий на основе данных полногеномного секвенирования (В.В. Шаповалова) |
| 9:45-10:15 | Филогеномика, видовое разнообразие и антибиотикорезистентность Stenotrophomonas spp. (В.В. Шаповалова) |
| 10:15-10:35 | Перерыв |
| 10:35-11:35 | Технологические решения GeneMind для геномных и метагеномных микробиологических исследований (В.С. Якимаха) |
| Практические занятия | |
| 11:35-12:00 | Контроль процесса нанопорового секвенирования (Э.Р. Шайдуллина, Т.А. Ягудин) |
| 12:00-13:00 | Перерыв |
| 13:00-15:00 | Системы высокопроизводительного секвенирования 2-го поколения: загрузка ячеек и запуск приборов (Э.Р. Шайдуллина, В.С. Якимаха) |
| 15:00-17:00 | Автоматизация выделения ДНК и подготовки библиотек для NGS. Демонстрация работы роботизированных станций (Э.Р. Шайдуллина, Д.П. Хачин, В.С. Якимаха) |
16 октября (четверг)
| Лекции | |
| 9:00-9:50 | Биоинформатический анализ данных геномного секвенирования (WGS): выявление и аннотация детерминант антибиотикорезистентности (В.В. Шаповалова) |
| 9:50-10:20 | Природные плазмиды Enterobacterales, связанные с распространением генов антибиотикорезистентности и вирулентности: выявление и описание на основе данных WGS (В.В. Шаповалова) |
| 10:20-10:40 | Перерыв |
| 10:40-11:15 | Современные молекулярно-генетические технологии, оборудование и расходные материалы компании Qvadros Bio (А.В. Лоскович) |
| 11:15-11:40 | Технология нанопорового секвенирования путем синтеза (NSBS) от компании Life Real для геномных и метагеномных исследований (Е.С. Толькова) |
| 11:40-13:00 | Перерыв |
| Практические занятия | |
| 13:00-15:00 | Биоинформатический анализ результатов геномного секвенирования: (I) Проверка качества данных секвенирования. Cборка генома. Метрики качества сборки генома (В.В. Шаповалова, Э.Р. Шайдуллина) |
| 15:00-16:00 | Биоинформатический анализ результатов геномного секвенирования: (II) Видовая идентификация (В.В. Шаповалова, Э.Р. Шайдуллина) |
| 16:00-17:00 | Биоинформатический анализ данных нанопорового секвенирования с использованием платформы EPI2ME (Т.А. Ягудин) |
17 октября (пятница)
| Практические занятия | |
| 9:00-10:40 | Биоинформатический анализ результатов геномного секвенирования: (III) Идентификация генов резистентности и вирулентности. Дополнительные вопросы. Обсуждение результатов (В.В. Шаповалова, Э.Р. Шайдуллина) |
| 10:40-11:00 | Перерыв |
| 11:00-11:40 | Интерактивный опрос |
| 11:40-12:00 | Закрытие семинара |
НМО
Семинар аккредитован в системе НМО (12 кредитов) по специальностям:
- бактериология
- вирусология
- генетика
- инфекционные болезни
- клиническая лабораторная диагностика
- клиническая фармакология
- лечебное дело
- медицинская микробиология
- организация здравоохранения и общественное здоровье
- эпидемиология
Регистрация
Внимание! Количество участников семинара ограничено. Решение о принятии к участию в семинаре принимается организационным комитетом на конкурсной основе.